Criada em 1997, a FAPES procurou, desde o início das suas atividades, estabelecer e ampliar parcerias com entidades governamentais e organizações privadas para a prestação de serviços de consultoria, assessoramento, administração de convênios, execução de contratos, realização de concursos públicos, processos seletivos, jornadas pedagógicas e cursos de formação de professores em diversos municípios.

É importante destacar o apoio recebido de alguns órgãos federais, estaduais e municipais, sem os quais não seria possível alcançar os objetivos da FAPES no sentido de melhor servir à sociedade baiana:

• »Companhia de Processamentos de Dados do Estado da Bahia (PRODEB);
• »Companhia de Processamento de Dados do Salvador (PRODASAL);
• »Fundação Cultural do Estado da Bahia (FUNCEB);
• »Secretaria de Administração do Estado da Bahia (SAEB);
• »Secretaria de Administração do Município de Salvador (SEAD);
• »Secretaria da Educação do Estado da Bahia (SEC);
• »Secretaria de Planejamento do Estado da Bahia (SEPLAN);
• »Secretaria Municipal da Educação e Cultura (SMEC);
• »Secretaria Municipal de Saúde (SMS);
• »Superintendência de Recursos Hídricos (SRH);
• »Universidade do Estado da Bahia (UNEB);
• »Universidade Estadual de Feira de Santana (UEFS);
• »Universidade Estadual de Santa Cruz (UESC);
• »Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia (UESB).